Les opposants au projet, y compris ceux qui critiquait son financement qatari, ont tenté à plusieurs reprises de l'arrêter, et des têtes de porc et du sang ont également été laissés sur le site.
Le chef de la communauté islamique, le Mufti Nedzad Grabus, a déclaré que l'ouverture de la mosquée était "un tournant dans notre vie".
"La Slovénie est le dernier ex-État yougoslave à avoir une mosquée, faisant de Ljubljana une capitale plutôt qu'une ville provinciale au bout du monde", a-t-il déclaré lors d'une conférence de presse.
Les musulmans du pays alpin à prédominance catholique ont déposé une demande de construction d'une mosquée à la fin des années 1960 alors que la Slovénie faisait toujours partie de l'ex-Yougoslavie communiste.
La communauté a finalement reçu l'autorisation il y a 15 ans, mais s'est heurtée à l'opposition de politiciens et de groupes de droite, ainsi qu'à des problèmes financiers.
La construction, qui a commencé en 2013, a coûté quelque 34 millions d'euros (39 millions de dollars), dont 28 millions d'euros de dons qataris, selon Grabus.
Située dans une zone semi-industrielle de Ljubljana, la mosquée, qui peut accueillir jusqu'à 1 400 personnes, constitue le noyau du centre culturel islamique de six bâtiments.
3876388