تسلط شیخ‌ بهایی در معماری و مهندسی، باعث شده تا ابعاد دیگر شخصیت علمی او پنهان بماند. وی قصیده‌ای در مدح امام زمان(عج) با عنوان «الفوز و الأمان» سروده است که مورد توجه بسیاری از عالمان و شاعران قرار گرفته و چندین شرح و ترجمه برای آن نوشته‌اند.