पैगंबर के मक्का से मदीना प्रवास के बाद, उमर, अबू बक्र, अब्दुल रहमान बिन औफ़ और कई अन्य लोग फ़ातिमा से शादी करना चाहते थे। इस बीच, हज़रत अली (अ.स.) को पैगंबर के साथ उनके पारिवारिक संबंधों और फ़ातिमा के नैतिक गुणों के कारण उनसे शादी करने में बहुत दिलचस्पी थी। लेकिन इतिहासकारों के मुताबिक, उन्होंने खुद को पैगंबर की बेटी को प्रपोज करने की इजाज़त नहीं दी। साद बिन मुआज़ ने इस मुद्दे को पैगंबर तक पहुंचाया और पैगंबर अली के प्रस्ताव पर सहमत हुए। अन्य प्रवासियों की तरह, प्रवास के बाद पहले महीनों में अली (अ.स.) की आर्थिक स्थिति कठिन थी, इसलिए, पैगंबर की सलाह पर, उन्होंने अपना ज़िरह बेच दिया (या गिरवी रख दिया) और कीमत फ़ातिमा की मुहर के रूप में निर्धारित की। अली (अ.स.) और फ़ातिमा (स.अ.) का विवाह समारोह मुसलमानों की उपस्थिति में पैगंबर (स.अ.व.) की मस्जिद में आयोजित किया गया था।
फातिमा (स.) और अली (अ.) के जीवन की पहली अवधि कठिन आर्थिक परिस्थितियों के साथ थी, यहां तक कि कभी-कभी उनके पास अपने बच्चों को खिलाने के लिए भोजन नहीं होता था। इन कठिन परिस्थितियों के बावजूद, फ़ातिमा (स.) ने मौजूदा स्थिति पर कोई आपत्ति नहीं जताई और कभी-कभी अपने पति की आजीविका कमाने में मदद करने के लिए ऊन कातती थीं। पैगम्बर (स.) की सलाह के आधार पर फ़ातिमा (स.) घर के अंदर का काम खुद करना चाहती थीं और घर के बाहर का काम अली (स.) पर छोड़ना चाहती थीं। जब हज़रत फ़िज़्ज़ह को नौकर बनाकर उनके घर भेजा तो उन्होंने घर का आधा काम ख़ुद किया और आधा काम फ़िज़्ज़ह पर छोड़ दिया।
अली (स.अ.व.) फ़ातिमा (स.अ.व.) का बहुत सम्मान करते थे। हज़रत अली (अ.स.) से रिवायत है कि उन्होंने कहा कि मैंने कभी फ़ातिमा को नाराज़ नहीं किया और न ही फ़ातिमा ने मुझे नाराज़ किया। शिया और सुन्नी सूत्र इस बात से सहमत हैं कि हसन, हुसैन, ज़ैनब और उम्म कुलषूम फ़ातिमा और अली के चार बच्चे हैं। शिया स्रोतों और कुछ सुन्नी स्रोतों में, उसके लिए एक और बच्चे का उल्लेख किया गया है, जिसका गर्भपात पैगंबर (PBUH) के बाद की घटनाओं के दौरान फातिमा को हुई क्षति के कारण हुआ था। उनका नाम मोहसिन या मोहस्सिन बताया गया है।
फ़ातेमह (PBUH) की कई सामाजिक गतिविधियाँ और राजनीतिक पद रहे हैं। मदीना में प्रवास, उहुद की लड़ाई के दौरान पैगंबर (पीबीयूएच) का इलाज, उहुद में हमजा की बहन और पैगंबर (पीबीयूएच) की चाची सफिया के साथ हमजा सैय्यद अल-शाहदा के शरीर के पास उपस्थिति, पैगंबर के लिए भोजन पहुंचाना (पीबीयूएच) खंदक की लड़ाई में और मक्का की विजय में उनका साथ देना पैग़म्बर की वफ़ात से पहली गतिविधियों में से हैं।
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