Дизайн мечети вдохновлен исламской архитектурой периода Сефевидов в Иране, включая 112-метровый минарет, восемь малых куполов и главный купол высотой 76 метров. Зал для молитв и главный купол поддерживается 12 столбами. Неф мечети Путра в Малайзии с куполом высотой 76 метров изобилует узорами и картинами из розовых цветов, которые привлекают к себе внимание каждого зрителя. Мягкие лучи света, проникающие в мечеть из окружающих окон, удвоили одухотворенность пространства.