Seyed Mustafa Khomeiny était le fils aîné de l'imam Khomeiny, un mujtahid chiite et un des combattants de la révolution islamique iranienne. Il a gravi les échelons académiques auprès de grands professeurs comme l'imam Khomeiny, l'Ayatollah Boroujerdi, Seyed Mohammad Mohaghig Damad, Seyed Mohammad Hodjat Koh Kamrehai et l'Ayatollah Khoei, et à l'âge de 27 ans, a atteint le droit de l'Ijtihad.
Seyed Mustafa Khomeiny a essayé de concrétiser la théorie du gouvernement islamique et a écrit le traité « Al-Islam wa Al-Hukuma » (L’Islam et le gouvernement). En plus d'apprendre les principes et la jurisprudence, il a également appris la philosophie, la théologie, le mysticisme, l’astronomie, l’histoire et le commentaire coranique. L'une des caractéristiques scientifiques de Seyed Mustafa était son regard critique dans le domaine des sciences islamiques.
Seyed Mohammad Mousavi Bojanvardi, un ami de Seyed Mustafa Khomeiny, estime que si la rédaction de ce commentaire était achevée, ce commentaire serait unique dans le monde du chiisme.
« La caractéristique la plus importante de ce travail qui le distingue des autres interprétations, est peut-être son exhaustivité. Seyed Mustafa Khomeiny pour écrire son commentaire, a examiné chaque verset sous l'angle de diverses connaissances. Le volume du commentaire est tel que le commentaire de la sourate Hamd et des 46 premiers versets de la sourate Baqarah a été publié en cinq volumes. L’auteur a abordé des sujets philosophiques et théologiques, et a en même temps, mentionné et expliqué des hadiths liés à chaque verset. Selon les spécialistes de l'interprétation, la méthode suivie par Seyed Mustafa Khomeiny dans ce commentaire, est la méthode de l'ijtihad utilisée dans la jurisprudence et les principes, qu’il a étendue à l’interprétation du Coran », a-t-il dit.