Selon le site ahram.org, les travaux ont porté sur le nettoyage des façades intérieures et extérieures, de la salle de prière et du minaret. Les spécialistes ont également traité les dépôts de sels et de calcaire afin de protéger les matériaux d'origine. 

Les colonnes en marbre ont été restaurées avec soin, tandis que la plaque fondatrice de la mosquée, conservée au Musée national de la Civilisation égyptienne, a retrouvé sa place sur la façade après sa restauration.

Selon Moustafa Sobhi, directeur général des Antiquités du Vieux Caire et superviseur du projet, toutes les interventions ont respecté les normes scientifiques de conservation afin de préserver l'authenticité architecturale de l'édifice.

L'histoire de la mosquée est particulièrement riche. Bien que son premier fondateur demeure inconnu, elle fut reconstruite en 1427 sous le règne du sultan mamelouk Al-Achraf Barsbay, puis rénovée en 1870 à l'époque ottomane sous Mohamed Mirza Pacha. Elle se distingue par son entrée ornée de muqarnas, son toit en bois surmonté d'une lanterne, son minaret à trois niveaux, son minbar sculpté et son mihrab décoré de motifs végétaux et d'inscriptions.

Fragilisée par le séisme de 1992, la mosquée avait déjà été restaurée entre 1994 et 2000 avant d'être fermée au culte en 2014 à cause de nouveaux problèmes structurels. Son nom, « Al-Saghir », fait référence à Mohamed ibn Abi Bakr, fils du premier calife de l'islam.