به گزارش خبرگزاری بین‌المللی قرآن (ایکنا) متن پیام آیت‌الله‌العظمی مکارم به شرح زیر است:
بسم الله الرحمن الرحیم
فقدان اسفناک عالم مجاهد حضرت آیت‌الله مهدوى کنى (رحمة الله علیه) موجب نهایت تأسف و تأثر گردید. این عالم ربانى در طول عمر پربرکت خود پیوسته در صف مقدم براى دفاع از اسلام و مکتب اهل بیت(علیهم السلام) و انقلاب اسلامى قرار داشت و از کسانى بود که هرگز مسیر خود را در فراز و نشیب‌ها و توفان‌هاى انقلاب تغییر نداد و نسبت به امام راحل(قدس سره) و رهبر انقلاب کاملا وفادار بود.
یکى از خدمات برجسته آن فقید سعید این بود که جوان‌هاى ارزنده فراوانى را در دانشگاهى که زیر نظر داشت، تربیت کرد و به کشور و نظام تحویل داد که بسیارى از آنها در سمت‌هاى مختلف حکومت اسلامى انجام وظیفه مى‌کنند.
این ضایعه بزرگ را به جامعه روحانیت و عموم مردم کشور به خصوص به بازماندگان گرامى‌اش تسلیت عرض مى‌کنم و علوّ درجات او را از خداوند متعال خواهانم.
تسلیت آیت‌الله علوی گرگانی
همچنین آیت‌الله علوی‌گرگانی در پیامی اظهار کرد: خبر ارتحال عالم ربانی و فقیه عالی‌مقام آیت‌الله آقای حاج شیخ محمدرضا مهدوی کنی موجب تأسف اینجانب شد. این عالم بزرگوار در دوران‌های مختلف زندگی منشاء خدمات مختلف به نظام و انقلاب و تربیت شاگردان مبرز و لایق بودند و در مواقع مختلف با موضع‌گیری‌های مناسب خویش در راستای تقویت انقلاب و دفاع از ولایت گام‌های مفیدی برداشتند.
ایشان در زمان مرحوم امام خمینی(ره) یار صدیق برای آن رهبر فرزانه بودند و به پیشبرد اهداف نظام کمک کردند و همچنین با پایه‌گذاری سبکی جدید در علم آموزی و جذب شاگردان شایسته به تربیت نیروهای متعهد همت گماشتند.
اینجانب این ضایعه را در درجه اول به محضر امام زمان(عج) و سپس به مقام معظم رهبری و مراجع عظام تقلید و همچنین به ملت شریف ایران و نیز به بیت شریف ایشان و همه دوستداران و شاگردان ایشان تسلیت گفته و صبر و اجر جزیل برای آنها از خداوند مسئلت می‌کنم.
تسلیت آیت‌الله العظمی صافی
آیت‌الله العظمی صافی گلپایگانی نیز در پیامش آورده است: رحلت عالم مبارز و روحانی وارسته مرحوم آیت‌الله آقای حاج شیخ محمّدرضا مهدوی‌کنی رحمة‌الله علیه موجب تأسّف و تأثّر شد. آن عالم مجاهد یکی از ارکان بزرگ انقلاب اسلامی بود که در مقاطع مختلف، نقش حسّاس و محوری داشت. خدمات شایسته ایشان به مراکز علمی و مذهبی و رشد و ارتقای فکری جوانان و پایبندی به اصول و ارزش‌های اسلامی، در خاطره‌ها همیشه باقی خواهد ماند.
اینجانب درگذشت این فقید سعید را به حوزه‌های علمیه و علمای محترم تهران و شاگردان و دوستداران ایشان به ویژه برادر ارجمندشان و آقازاده‌گان محترم و دامادهای مکرّم تسلیت گفته و غفران و مزید رحمت الهی را برای آن مرحوم مسئلت می‌کنم.
پیام آیت‌الله نوری همدانی
همچنین آیت‌الله العظمی نوری‌همدانی نیز در پیامی به این مناسبت آورده است: آیت‌الله مهدوی‌کنی که از پیشتازان حرکت انقلاب اسلامی در مبارزه با رژیم منحوس پهلوی بودند، عمر پر برکت خود را در راه ترویج اسلام، مکتب تشیع، آرمان‌های امام خمینی(ره) و اهداف رهبر معظم انقلاب سپری کرد.
آیت‌الله مهدوی‌کنی پس از انقلاب با قبول مسئولیت‌های مختلف نقش مهمی در پیشبرد اهداف انقلاب اسلامی داشتند و خدمات ارزنده‌ای را به نظام مقدس جمهوری اسلامی ایفا کردند.