وی با اشاره به ایجاد سه رشته مشترک در دانشگاه‌های موسسه در قم، تهران و اصفهان اظهار کرد: در کارشناسی، 7 رشته داریم که کلام اسلامی، فقه و حقوق اسلامی، تربیت معلم قرآن و ... از جمله این رشته ها است.
وی افزود: در پذیرش دانشجو در مقطع دکتری ابتدا از وزارت علوم اقدام می‌شد اما در چندسال اخیر به دو صورت کنکور و امتحان اختصاصی، پذیرش داریم.
برنجکار گفت: در کارشناسی ارشد 13 رشته از جمله علوم حدیث با گرایش اخلاق، تفسیر اثری، نهج البلاغه، علوم قرآن و حدیث، تفسیر روایی، ارتباطات با گرایش حج و زیارت، روان شناسی اسلامی و معارف قرآن، کلام امامیه، علوم حدیث، اخلاق و آداب پزشکی تدریس می شود و در دکتری نیز 7 رشته از جمله مدرسی معارف اسلامی با گرایش قرآن، علوم و معارف نهج البلاغه، کلام امامیه، تفسیر تطبیقی و ... را داریم.
رئیس ستاد برگزاری بیستمین سالگرد تاسیس موسسه ادامه داد: هدف اصلی ما از تاسیس دانشگاه کارهای بین رشته ای علوم قرآن و حدیث با رشته های تخصصی است؛ ما درصدد پیوند میان این دو هستیم تا فرمایش رهبری در این زمینه محقق شود تا ما دائما مبانی غربی در اقتصاد، روان شناسی و ... مقلدانه تبیین نشود.
وی تاکید کرد: نظریه‌پردازی در خلا انجام نمی‌شود، ابتدا باید سیر علمی تدوین و باید در این زمینه مکتب و مبانی اعتقادی و عملی داشته باشیم و این مبانی را می‌توان از قرآن و حدیث گرفت، همان طور که دیگران از دیدگاه‌های مکاتب خود می گیرند؛ ما باید به قرآن و حدیث برگردیم و مبانی پایه ای را از آنجا بگیریم.
برنجکار تصریح کرد: 22 کتاب درسی برای رشته‌های میان رشته‌ای تولید شده است همچنین 126 اثر اصلی در مجلدات گوناگون تولید شده است و در کنگره‌ها نیز 5 کنگره اجرا شده و 89 اثر در این کنگره‌ها تولید شده و 48 عنوان کتاب نیز در معاونت فرهنگی تولید شده و مجموع آن به 325 اثر می‌رسد.
وی عنوان کرد: رشته تخصصی حدیث در سطح سه در حوزه ایجاد شد و فارغ التحصیلان این موسسه این رشته را ایجاد کردند و برخی رشته های ما نیز در دانشگاه تهران در حال اجراست.
برنجکار با اشاره به تحصیل 2 هزار و 891 دانشجو در مقطع کارشناسی، هزار و 898 نفر در مقطع ارشد و 187 نفر در مقطع دکتری اظهار کرد: در مجموع نزدیک به 5 هزار نفر در دانشگاه های وابسته به این موسسه فعالیت دارند همچنین بیش از دو هزار نفر در کارشناسی، بیش از هزار نفر در ارشد و 24 نفر در دکتری فارغ‌التحصیل شده‌اند و 55 نفر نیز عضو هیئت علمی دانشگاه هستند.