«خبر درگذشت فرهیخته وارسته مرحوم محمدجواد صاحبی موجب تألم و تأسف شد. آزاداندیشی در عین دین باوری و دین مداری از مهم ترین مؤلفه‌های شخصیتی مرحوم صاحبی بود.
تلاش‌های ستودنی وی در حوزه‌های اندیشه، فرهنگ دینی و رسانه در دهه‌های متوالی کارنامه درخشانی از زندگانی پربرکت او بر جای نهاده است. ضمن عرض تسلیت فقدان ایشان به جامعه علمی و دینی کشور و خانواده آن مرحوم از خداوند متعال برای او علو درجات و همنشینی با اولیای دین در جوار رحمت الهی و صبر و شکیبایی بازماندگان محترم را خواستارم.»
براساس این گزارش؛ در متن پیام تسلیت محسن جوادی، معاون امور فرهنگی وزیر ارشاد آمده است: «خبر درگذشت استاد محمدجواد صاحبی، رئیس هیئت‌مدیره و شورای علمی دین‌پژوهان کشور و از محققان حوزه تاریخ و دین، جامعه علمی و دینی کشور را در سوگ نشاند. وی عمری را در محضر مقام معظم رهبری و بزرگانی، چون آیت‌الله محمدابراهیم جناتی، آیت‌الله سیدعبدالکریم موسوی اردبیلی، آیت‌الله حسن حسن‌زاده آملی، استاد سیدجلال‌الدین آشتیانی، آیت‌الله سیدعزالدین زنجانی، آیت‌الله محمدهادی معرفت و دیگران بهره برد.
شناخت‌نامه قرآن، شناخت‌نامه تفاسیر، دین‌پژوهی در جهان معاصر، سفر به هفت وادی عشق، احیای ارزش‌ها در عاشورا و تفسیر تاریخ سرخ از جمله پژوهش‌های وی است که در خاطره پژوهشگران و محققان خواهد ماند و جامعه علمی کشور از آن‌ها بهره‌ها خواهد برد.
برای این فرهیخته متواضع و پر تلاش، که عمر خود را صرف تعالی دین و ارزش‌های دینی و علمی ساخت، از خداوند متعال علو درجات و غفران الهی و برای خانواده بزرگوار ایشان ضمن عرض تسلیت و تعزیت، شکیبایی و سعادت خواستارم.»
یادآور می‌شود، محمدجواد صاحبی، شب گذشته در سن 64 سالگی درار فانی را وداع گفت.
انتهای پیام