متن پیام به این شرح است:
«شهید دکتر محسن فخری‌زاده عزیز، یکی از خادمان علمی و فناوری و دانشمندان خبره نظام مقدس جمهوری اسلامی، توسط ایادی استکبار جهانی و رژیم پلید صهیونیستی، بخون خود غلتید و همچون سایر یاران شهیدش به لقاء الله پیوسته و روح مطهر و بلند دانشمند هسته‌ای و مجاهد نستوه، در جوار علیین و ابرار و ارواح مقدس شهیدان کربلا و سیدالشهدا و حضرت اباعبدالله الحسین علیهما السلام آرام گرفت.
اتحادیه مؤسسات و تشکل‌های قرآن و عترت(ع) و مجمع پیشکسوتان و اساتید قرآن استان آذربایجان شرقی، ضمن محکوم نمودن این ترور ناجوانمردانه، شهادت دانشمند تراز اول انقلاب را که در آستانه سالگرد شهادت سردار بزرگ سپاه اسلام، شهید حاج قاسم سلیمانی و دانشمند هسته‌ای شهید شهریاری، توسط ایادی مزدور اسرائیل جنایتکار به فیض شهادت نائل آمدند، را به ساحت مقدس حضرت صاحب الامر ارواحنا له فداه، مقام معظم رهبری، امت حزب الله و جامعه قرآنی کشور، تسلیت عرض نموده و دیگر بار با شهیدان عزیز میثاق می‌بندد، با بهره‌گیری از شخصیت والای این شهدای عظیم الشان، اعلام می‌دارد که در گام دوم انقلاب با تمام توان، امیرانه ایستادگی کرده و تا به ثمر نشستن خون شهیدان به حرکت خود ادامه خواهد داد.
بدیهی است سیاست ورزان و مجریان داخلی و در رأس آن دولت و دستگاه دیپلماسی جمهوری اسلامی ایران، بعد از کنش‌ها و واکنش‌های فراوانی که تاکنون در فضای بین المللی مشاهده شده است، باید حرکت مبتنی بر الفبای غیرت را سرلوحه گفتار و رفتار داخلی و خارجی ساخته و دشمن زبون را آن چنان که ایرانی مسلمان و انقلابی و با شرف باید بشناسد، بشناسند و عمل متناسب با عزت، حکمت و مصلحت و در شأن نظام انقلابی داشته باشند.
دشمنان قسم خورده و کوردل ملت ایران بدانند که با شهادت دانشمندان علمی کشور همچون شهیدان والا مقام فخری‌زاده، شهریاری، علی محمدی، رضایی نژاد و احمدی روشن‌ها، مسیر رشد و استقلال و مقاومت ملت اسلامی ایران هرگز متوقف نخواهد شد بلکه زمینه رشد و بالندگی تربیت شدگان مکتب این شهیدان در عرصه‌های نظامی، هسته‌ای و دفاعی با سرعت بیشتری از گذشته پیش خواهد رفت و همچنین ملت قهرمان و مجاهد ایران در طول سال‌های گذشته، ثابت کرد که اینگونه اقدامات تروریستی، هیچ خللی در اراده راسخ آنان ایجاد نخواهد کرد و همچون همیشه، سربلند و پرشکوه، دست از آرمان‌های استکبارستیز و ضدیت با رژیم منحوس صهیونیستی، برنخواهد داشت و پاسخ قاطع و کوبنده خود را در فرصت مقتضی و عاجل، خواهد داد».