همچنین، تفاهم‌نامه همکاری میان دانشگاه مذاهب اسلامی و مرکز مطالعات ادیان(icrs) دانشگاه گاجامادای(UGM) اندونزی مردادماه 97 امضا شد.
تبادل اساتید، دانشجویان و برگزاری دوره‌های مطالعاتی مشترک، تدوین مجلات و متون درسی مشترک، برگزاری سمینارهای علمی مشترک، ارتباطات علمی و برگزاری دوره‌های دانش‌افزایی و مطالعات ادیان و مذاهب و تفسیر متون از جمله محورهای این تفاهم‌نامه همکاری است.